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组件记忆库

组件记忆库是一个跨会话的持久化存储系统,用于保存您在多次研究会话中使用的生物组件——序列、构建体和元件。通过/memory命令访问。

从外部数据库获取的序列会自动存入您的记忆库:

  • NCBI获取的序列(按基因名或Accession号)连同原始注释一起保存
  • Addgene获取的质粒连同完整的feature图谱一起保存
  • 您设计的构建体(组装序列、表达盒)在每个构建步骤后保存

这意味着您永远不需要重新获取已经使用过的序列——它始终在您的库中可用。

使用多种搜索策略在库中查找组件:

搜索模式说明
名称搜索按精确或部分名称匹配查找组件
模糊匹配即使名称近似或拼写错误也能定位组件
正则表达式使用正则表达式进行高级模式搜索
序列相似性类BLAST的相似性搜索,按序列同源性查找组件

记忆库跟踪组件之间的parent-child关系。当您将片段组装成构建体时,记忆库记录使用了哪些元件以及它们是如何组合的。这让您能够:

  • 将任何构建体追溯到其原始源序列
  • 了解复杂多元件构建体的组装历史
  • 查找使用特定元件或基因的所有构建体

为任何组件添加备注和标签以便组织管理。标签可以表示类别(如”启动子”、“抗性标记”)、项目或任何适合您工作流的自定义分类系统。

一键将库中的任何组件加载到当前工作会话。加载的组件立即可用于分析、修改或在新组装设计中使用——无需重新导入或从外部来源重新获取。