序列获取与管理
这是AI Scientist最核心的差异化能力——不是用文字”讨论”克隆方案,而是在对话中直接完成从序列获取到组装模拟的全流程。
多源序列获取
Section titled “多源序列获取”AI Scientist使用优先级决策树自动寻找最佳序列来源:
| 优先级 | 来源 | 说明 |
|---|---|---|
| 1 | 组件记忆库 | 优先检索您之前保存的序列 |
| 2 | NCBI | 按基因名或Accession号获取DNA序列(支持批量获取) |
| 3 | UniProt | 按蛋白名称或ID获取蛋白质序列(支持批量获取) |
| 4 | Addgene | 搜索和获取公共质粒及其序列 |
| 5 | 标准载体库 | 内置2800余种标准载体可供直接选用 |
当您请求序列时,AI Scientist按顺序检查每个来源——首先从您自己的库中查找以复用之前整理过的序列,然后回退到公共数据库。NCBI和UniProt支持批量获取,允许您在单次请求中获取多条序列。
序列操作工具箱
Section titled “序列操作工具箱”序列加载到当前会话后,您可以使用全面的操作工具集:
- 创建/重命名/删除 — 管理工作区中的序列
- 提取子序列 — 按坐标或feature注释提取特定区域
- 反向互补 — 生成互补链
- 拼接 — 将多条序列首尾相连
- 点突变 — 引入特定的核苷酸或氨基酸变化
- 区域插入/删除 — 在指定位置添加或移除序列片段
- 限制性内切酶位点搜索 — 查找特定酶或常用克隆酶集的切位点,适用于domestication工作流
- 序列导出 — 以GenBank、FASTA或JSON格式下载,用于外部工具