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序列获取与管理

这是AI Scientist最核心的差异化能力——不是用文字”讨论”克隆方案,而是在对话中直接完成从序列获取到组装模拟的全流程。

AI Scientist使用优先级决策树自动寻找最佳序列来源:

优先级来源说明
1组件记忆库优先检索您之前保存的序列
2NCBI按基因名或Accession号获取DNA序列(支持批量获取)
3UniProt按蛋白名称或ID获取蛋白质序列(支持批量获取)
4Addgene搜索和获取公共质粒及其序列
5标准载体库内置2800余种标准载体可供直接选用

当您请求序列时,AI Scientist按顺序检查每个来源——首先从您自己的库中查找以复用之前整理过的序列,然后回退到公共数据库。NCBI和UniProt支持批量获取,允许您在单次请求中获取多条序列。

序列加载到当前会话后,您可以使用全面的操作工具集:

  • 创建/重命名/删除 — 管理工作区中的序列
  • 提取子序列 — 按坐标或feature注释提取特定区域
  • 反向互补 — 生成互补链
  • 拼接 — 将多条序列首尾相连
  • 点突变 — 引入特定的核苷酸或氨基酸变化
  • 区域插入/删除 — 在指定位置添加或移除序列片段
  • 限制性内切酶位点搜索 — 查找特定酶或常用克隆酶集的切位点,适用于domestication工作流
  • 序列导出 — 以GenBank、FASTA或JSON格式下载,用于外部工具