引物设计
AI Scientist内置16种以上专业引物设计工具，通过/primers命令使用。这些工具覆盖分子生物学研究中几乎所有的引物需求，从标准PCR到高级诱变策略。
| 引物类型 | 说明 |
|---|---|
| 标准PCR引物 | 指定模板和扩增区域，自动设计正/反向引物 |
| Gibson组装引物 | 自动添加25-40bp重叠区，适配多片段组装 |
| 定点突变引物 | 设计引入特定点突变的mutagenesis引物 |
| 位点饱和突变引物（SSM） | 用简并密码子（NNK/NNS等）覆盖目标位点的所有氨基酸变体 |
| 组合突变引物（COMBI） | 多位点分组组合突变，用于酶工程 |
| PAS寡核苷酸 | 大片段/寡核苷酸文库设计 |
| 测序引物 | 按步进间距覆盖全序列的测序引物设计 |
| Colony PCR引物 | 验证转化子的菌落PCR引物 |
| SOE引物 | Splicing by Overlap Extension引物设计 |
| 插入引物 | 用于标签/linker插入的引物设计 |
| 反向PCR引物 | 载体线性化用的向外引物 |
AI Scientist设计的每条引物都会经过自动质量检查：
- 发卡检测 — 识别可能降低引物效率的潜在二级结构
- 二聚体分析 — 检查引物对之间的自身二聚体和交叉二聚体
- GC clamp — 验证3’末端稳定性，确保可靠退火
- Tm匹配 — 确保正向和反向引物具有兼容的解链温度
对于大规模项目，AI Scientist支持批量引物Campaign。您可以一次提交多个目标，系统将：
- 在现有引物库中搜索已设计的匹配引物
- 仅为缺少覆盖的目标设计新引物
- 将所有结果整合到统一的订购表中
一键导出引物订购表（CSV/TSV格式），可直接提交给寡核苷酸合成供应商。